首先，由于智齿萌出不全，所以后侧的牙龈遭到覆盖，其部分牙冠形成的冠周袋会不停的积存食物和细菌，这样会造成局部软组织经常出现发炎，疼痛难忍的现象，严重的话甚至会导致张口受限进而致使进食困难。

　　其次，大多数智齿都是前倾阻生的，即约呈45度角顶在第二磨牙上，两个牙冠形成一个夹角嵌塞食物，时间久了第二磨牙形成龋坏直至牙髓炎而剧痛。另一个后果是前倾的智齿持续加力于第二磨牙使其形成牙周炎而疼痛松动，不得不拔除第二磨牙或必须拔除这两颗牙，否则这样咀嚼功能就会严重受损。

　　第三，有的智齿虽然萌出方向大致正常，但与第二磨牙的接触点不正常，以致经常嵌塞食物，并且刷牙时不易刷到此处牙间隙，而较易造成第二磨牙龋坏而缩短寿命。